Viranomaisilla on oikeus tarkastaa aluksia omilla aluevesillään. Suomessa (ja useimmissa muissa valtioissa) tämä perustuu sekä kansalliseen lainsäädäntöön että kansainvälisiin sopimuksiin.
Suomen aluevesillä (territoriaalivesillä)
Aluevesillä tarkoitetaan merialuetta, joka ulottuu enintään 12 meripeninkulmaa (n. 22 km) rannikkovaltion perusviivasta. Tällä alueella Suomi käyttää täysimääräistä suvereniteettiaan, mukaan lukien:
Rajavartiolaitos, Tulli, Poliisi, ja Liikenne- ja viestintävirasto (Traficom) voivat tarkastaa aluksia eri tarkoituksiin, kuten:
turvallisuusvalvonta
ympäristönsuojelu
merenkulun sääntöjen noudattaminen
rikostutkinta tai salakuljetuksen estäminen
Ulkomaisten alusten osalta
Ulkomaalaisilla aluksilla on oikeus niin sanottuun rinnakkaiskulkuun (innocent passage) aluevesillä, mutta tämä ei estä viranomaisia puuttumasta tilanteisiin, jos:
alus rikkoo aluevesien sääntöjä tai
on syytä epäillä rikollista toimintaa tai
alus vaarantaa valtion turvallisuuden tai järjestyksen.